苦瓜生吃、熟吃都能可以的，但生吃味儿非常重，并不像别的蔬菜水果。且注意苦瓜寒性，脾胃虚弱即食用寒性食物非常容易腹疼、拉肚子的人群不适合生吃，食用后也许会使病症加剧，孕妈妈也应尽量避免吃，寒性食物很有可能会提升孑宫不正常收拢的风险性。食用苦瓜时还应尽量减少与此同时食用别的寒性食物，如巨蟹、冬瓜等，以防刺激性消化道，引起不适感。

苦瓜做为食药同源的食材，具备清热解毒、祛毒、明目地作用，适度食用针对中署、急性肠炎、眼睛痛、解渴(糖尿病患者)等症状有一定协助。尤其是容易上火的人群，适当食用苦瓜可以协助清热解毒下火。与此同时，苦瓜含有维他命C、锌元素、苦瓜人参皂甙、苦瓜灵芝多糖、苦瓜黄酮类等，而糖、蛋白、维生素B族等微量元素过少，且苦瓜生吃时营养元素摄取会更全方位。此外研究发现，苦瓜中带有清脂素，生吃针对减肥瘦身人群有利。
苦瓜有苦涩味是其富含的苦叶素及其野黄瓜汁酶相互影响造成。若感觉苦瓜生吃苦涩味过重，也可熟吃，但一部分营养元素也会有一定的外流。可依据自己需要挑选食用方式，老人及其对味儿比较敏锐的人群，提议将苦瓜烹调熟后再食用。